厭氧生物反應器內出現中間代謝產物積累的原因：
(1)水力負荷過大。水力負荷過大會使消化時間變短，降低了有機物在反應器內的停留時間，使甲烷菌的活動能力下降。
(2)有機負荷過大。進水有機負荷突然加大，使產酸速度超過甲烷菌對揮發酸(VFA)的利用速度，形成VFA的積累，反應器內pH值降低。
(3)攪拌效果不好。攪拌系統出現故障，未能及時排除而導致攪拌效果不佳，會使局部VFA積累。
(4)溫度波動大。溫度波動太大，可降低甲烷菌分解VFA的速率，導致VFA積累。溫度波動如果是由進水量突然加大所致，就應當控制進水量；如果是因為加熱控制不當所致，則應加強加熱力度。
(5)進水中含有有毒物質。甲烷菌中毒后，分解VFA的速率下降，使VFA含量增加。遇到這樣的情況首先要明確造成甲烷菌中毒的原因，如果是重金屬類中毒，可加入硫化鈉降低其濃度；如果是硫化物濃度高引起的中毒，可加人鐵鹽降低S2_濃度。但這些都是補救措施，應當以控制進水質量為根本，從源頭加以解決。
